Baranyiモデルへのフィッティング (速度論モデル)

Weibullモデルに付随してBaranyiモデルへのフィッティングの仕方もわからないとの声をいただくので、簡単なものですが作成したので共有してみようと思います。

・平均値、標準偏差を計算してある場合　　　 Baranyi fitting (curve_fit).ipynb

https://colab.research.google.com/github/Hiroki-Abe/Baranyi_fitting/blob/main/Baranyi%20fitting/Baranyi%20fitting%20(curve_fit).ipynb

・平均値、標準偏差を計算していない場合　　　 Baranyi fitting (curve_fit) No S.D. data.ipynb

https://colab.research.google.com/github/Hiroki-Abe/Baranyi_fitting/blob/main/Baranyi%20fitting/Baranyi%20fitting%20(curve_fit)%20No%20S.D.%20data.ipynb

適宜、変更等行い、ご自由にお使い下さい。（2023/05/24）

算出されるmu_maxの数値に誤りがあったので、修正いたしました（2023/07/06）

↓　Githubリンク

https://github.com/Hiroki-Abe/Baranyi_fitting

フィッティング例

https://scrapbox.io/files/6467007fa27fa9001b72a1ef.png

例題用データは以下の論文から引用

Fuchisawa, Y., Abe, H., Koyama, K. & Koseki, S. Competitive growth kinetics of Campylobacter jejuni, Escherichia coli O157:H7 and Listeria monocytogenes with enteric microflora in a small-intestine model. Journal of Applied Microbiology (2021) doi:10.1111/jam.15294.